Jan 3 volgde zijn vader op in 1297, nadat deze gesneuveld was bij de slag van Vronen. Jan III breidde het Arkelse grondbezit verder uit en kocht landerijen in Holland en Brabant en was raadsman van bisschop Gwijde van Avesnes van Utrecht. In 1304 kreeg hij het grondbezit van de heren van Ter Leede, omdat de familietak was uitgestorven en de van Arkels eerste in lijn waren.
Van Arkel is in 1315 mee op veldtocht met Willem III van Holland in Vlaanderen, waar tegen de graaf van Vlaanderen werd gevochten nabij Kortrijk. In de periode 1317-19 wordt Van Arkel aangesteld als een soort van 'beschermheer' voor de nieuw gekozen bisschop Frederik van Sierck van Utrecht. Deze bisschop werd benoemd door Willem III van Holland, echter zijn de Stichtenaren hier niet blij mee en moet Van Arkel deze menigte bedwingen. In 1318 plundert de heer van Lienden met zijn volgelingen in de Neder-Betuwe en het Sticht, Van Arkel moet deze benden uitschakelen.
Hij stond hoog in de gunst bij Willem III van Holland en werd in 1321 belast om als scheidsrechter uitspraak te doen in de geschillen tussen Willem III van Holland en Jan I van Brabant. In de volgende jaren is Jan III niet meer in de gunst. Mogelijk is hij op de achtergrond gedrongen door Willem van Duivenvoorde. Ook in 1321 benoemt hij zijn oudste zoon tot drossaard van Ter Leede. Deze gaat als Jan van der Lede door het leven tot 1324 (na het overlijden van Jan III) wanneer hij zich gewoon weer Van Arkel noemt.
Jan is begraven in de Grote kerk van Gorinchem, bij zijn eerste vrouw Mabelia. Omdat zijn zoons nog te jong waren om te regeren, nam zijn broer Nicolaas van Arkel het voogdschap waar.
Bron o.a.: Wikipedia; genealogieonline, stamboom Baris; Waale (1990)