Hendrick is twee keer getrouwd geweest, Eerst, voor 1565 met Marijke Oerlemans en daarna, zoals uit zijn testament blijkt, voor die testamentsdatum van 11 oktober 1588 met Lijske Jacob Tonisdr.
Hendrick is relatief kort na het opstellen van dat testament overleden, aangezien hij in ieder geval voor 5 mei 1590 gestorven is. Daarna is Lijske hertrouwd met Joost Joosten. Op 16 april 1594 koopt deze Joost Joosten een "huis en geseet" uit naam van Gelden Mertsenz. de Bie, een broer van Hendrick, en in februari 1608 treedt hij op als man van Lijske voor haar voor-kinderen. Dat wijst erop dat Lijkse en Hendrick samen kinderen hebben gehad.
Van Hendrick is een zoon bekend, namelijk Jacob Hendricksz. de Bie, overleden voor 22 februari 1645. Daarnaast is ook vermoedelijk Aleyd Hendricksdr de Bie, gehuwd met Hendrick Stoffelsz van Gils, een kind van Hendrick. Aanwijzingen dat deze Aleyd en dochter van Hendrick is, zijn ook
Aleyd heeft haar zevende kind Marten genoemd, dus mogelijk naar haar grootvader
op 16 febr. 1630 is er sprake van een land waarvan Oost ligt: Jacob Hendrick (Mertensz) de Bie en West: Hendrick Stoffelsz. van Gils, de man van Aleyd Hendricksdr. de Bie.
