Bij het huwelijk van Francois en Magdalena was zijn vader Jacob de With, ook wonend aan de Steenschuuur in Leiden, getuige en haar schoonzuster Maya Bout, wonend aan de Cortsteech in Leiden.
Francois en Magdalene hebben samen tenminste 6 kinderen gekregen,
Adrianus de Witte (doop op 7-8-1657 te Leiden. Getuigen waren Maria Bout en Tobias de Witte)
Francijntje de Witte
Jacoba de Witte (doop op 3-5-1661 te Leiden. Getuigen waren Susanna de Witte en Egbert Bout). Jacoba is op 22 september 1683 te Leeuwarden gehuwd met Femmerus van der Leij, advocaat van het Hof van Friesland. In 1698 vestigd hij zich met zijn vrouw in Barderadeel. Hij komt dan uit Britsum, de plaats waar zijn zwager Benjamin Bekius predikant is, en zij uit Leeuwarden.
Maria de Witte (doop op 2-5-1663 te Leiden. Getuigen waren Dirck Bout en Adriana Starremont)
Maria de Witte (doop op 19-4-1665 te Leiden. Getuigen waren Cornelia van Schoten en Cornelis van Oostduyvelant)
Susanna de Witte (doop op 24-4-1667 te Leiden. Getuige waren Elizabeth Raket en Tobias de Witte)