Johannes heeft in 1676 en 1678 een huis aan de Peperstraat (nu nr 9) gekocht. Hierin is ook zijn boekdrukkerij gevestigd. Zijn stiefzoon en stiefkleinzoon hebben deze zaak voortgezet. Dit pand is later bekend geworden als "de Jonge Ruyter", vermoedelijk vernoemd naar Johannes.
